El museo fue inaugurado el 14 de setiembre del año 2013. Resguarda y expone bienes culturales arqueológicos procedentes de proyectos de investigación arqueológica realizados en los sitios arqueológicos Plaza Kancha, Watoqto y Ninamarka, importantes asentamientos de época Inca ubicados en la provincia de Paucartambo, así como diversos bienes de cerámica y textil producidos por las comunidades actuales. Cuenta con cuatro salas de exposición permanente denominadas Paucartambo: confluencia amazónica andina en el Antisuyo, Comunidades andinas y sus tejidos sociales, Perfil amazónico andino de Paucartambo y Mamacha del Carmen: rutas religiosas, redes sociales y ritmos de la fe. Resalta la última sala dedicada a la Fiesta de la Virgen del Carmen, en donde se muestran los trajes de las 19 danzas que se realizan durante los días de fiesta en el mes de julio de cada año.
Por trabajos de virtualización de la colección, el museo estará cerrado los días 5, 6 y 9 de febrero del 2024.