| Nombre del Museo | Institución | Administración | Región | Resolución de Incorporación | Fecha de Incorporación |
|---|---|---|---|---|---|
| Museo Huauco | - | Privada | Cajamarca | Resolución Directoral Nº 1305/INC (42.22 KB) | 27/09/2005 |
| Museo Afroperuano | Consejo Directivo del Museo | Privada | Lambayeque | Resolución Directoral Nacional N° 915 /INC (62.16 KB) | 23/09/2004 |
| Museo Aeronáutico del Perú | Fuerza Aérea del Perú | Pública | Lima | RDN N° 593-INC (109.6 KB) | 06/08/2004 |
| Museo "Complejo Histórico Benemérita Guardia Civil del Perú-ACENESPAR GC" | - | Privada | Lima | Resolución Directoral Nacional N° 276 /INC (68.49 KB) | 14/04/2004 |
| Museo del Colegio Militar "Elías Aguirre" | Colegio Militar Elías Aguirre | Pública | Lambayeque | Resolución Directoral Nacional N° 745 /INC (76.77 KB) | 22/10/2003 |
| Cementerio Museo Presbítero Matías Maestro | Sociedad de Beneficencia de Lima | Pública | Lima | Resolución Directoral Nacional N° 593/INC (64.99 KB) | 12/08/2003 |
| Sala Postal y Filatélica de Tacna | Serpost | Pública | Tacna | Resolución Directoral Nacional N° 812 /INC (50.49 KB) | 03/09/2002 |
| Museo de Sitio de Ancón "Alejando Miró Quesada Garland" | Patronato del Museo de Sitio de Ancón | Privada | Lima | Resolución Directoral Nacional N° 081 /INC (84.07 KB) | 05/02/2002 |
| Museo Leymebamba | Privada | Amazonas | Resolución Directoral Nacional Nº 080- INC (45.05 KB) | 05/02/2002 | |
| Museo Histórico de Ciencias Físicas de la Universidad Nacional Mayor de San Marcos | Universidad Nacional Mayor de San Marcos | Pública | Lima | Resolución Directoral Nacional N° 1078 /INC (97.5 KB) | 06/11/2002 |