La sala de exposición abrió sus puertas el 15 de agosto del año 2002. Presenta información sobre la zona arqueológica monumental, mapas, fotografías y bienes culturales recuperados en dicho lugar. Destaca la osamenta de un animal prehistórico y su caparazón.
En el año 2002 se concibió el proyecto del Museo Inkariy con una visión panorámica del Perú prehispánico con proyección a lo contemporáneo, poniendo énfasis en el factor humano de las sociedades y complementar la memoria de los peruanos sobre los logros tecnológicos de nuestros antepasados como herencia cultural, a través de la historia y tradiciones, de un lenguaje moderno y Accesible para su puesta en valor. Los fondos museográficos están conformados principalmente por bienes arqueológicos y etnográficos.
El Museo Histórico Regional, Casa del Inca Garcilaso de la Vega, fue creado el 1 de marzo de 1967, ofrece a sus visitantes trece salas de exhibición permanente y una sala de exposición temporal; dividido en dos niveles, el museo presenta en el primer nivel un total de seis salas de exhibición con material arqueológico correspondiente a diferentes desarrollos culturales presentes en el valle del Cusco. El segundo nivel del museo exhibe siete salas con bienes histórico artísticos y etnográficos.
La creación del museo surge hacia la década de 1960 - 1970 por iniciativa del Dr. Manuel Chávez Ballón, y luego de diferentes procesos de remodelación se concreta su reapertura con un nuevo enfoque museográfico el 25 de julio de 2005.