El museo forma parte del Instituto Nacional de Ciencias Neurológicas, ubicado en el antiguo Hospital Santo Toribio de Mogrovejo en Barrios Altos, fue inaugurado el 26 de agosto de 1997. Surgió de la necesidad de complementar académicamente la formación de estudiantes de medicina, escolares y universitarios. Constituye un escenario de aprendizaje en neurociencias y es reconocido como el único en su género en Latinoamérica. Cuenta con una colección de 2000 cerebros humanos conservados y una exhibición de 300 de ellos, distribuidos en una sala de cerebros sin patologías, una sala de fetos con malformaciones del sistema nervioso y una gran sala con enfermedades del cerebro. Asimismo, expone la colección más completa de cortes de cerebros con patologías neurológicas. También cuenta con una pequeña colección de cerebros de animales menores. Este museo es considerado un importante referente para el aprendizaje sobre prevención y salud neurológica.
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