| Nombre del Museo | Institución | Administración | Región | Resolución de Incorporación | Fecha de Incorporación |
|---|---|---|---|---|---|
| Museo Conmemorativo Inmigración Japonesa en el Perú | Asociación Peruano Japonesa | Privada | Lima | Resolución Jefatural Nº 102 | 27/03/1989 |
| Museo del Ejército "Real Felipe" | Ministerio de Defensa | Pública | Callao | Resolución Jefatural Nº 102 | 27/03/1989 |
| Museo Central de la Universidad Nacional Federico Villareal | Universidad Nacional Federico Villareal | Pública | Lima | Resolución Jefatural Nº 102 | 27/03/1989 |
| Museo de los Combatientes del Morro de Arica | Ministerio de Defensa | Pública | Lima | Resolución Jefatural Nº 102 | 27/03/1989 |
| Museo de Sitio Pucllana | Ministerio de Cultura | Pública | Lima | Resolución Jefatural Nº 102 | 27/03/1989 |
| Museo Cáceres | Ministerio de Defensa | Pública | Lima | Resolución Jefatural Nº 102 | 27/03/1989 |
| Casa Museo "Julia Codesido" | - | Pública | Lima | Resolución Jefatural Nº 155 | 12/04/1989 |
| Museo Santuario "Leoncio Prado"-La Perla | Centro Educativo Leoncio Prado | Pública | Callao | Resolución Jefatural Nº 102 | 27/03/1989 |
| Museo Arqueológico Josefina Ramos de Cox | Instituto Riva Agüero-Pontificia Universidad Católica del Perú | Privada | Lima | Resolución Jefatural Nº 102 | 27/03/1989 |
| Museo Criminalística (PIP) | Policía Nacional del Perú | Pública | Lima | Resolución Jefatural Nº 102 | 27/03/1989 |