| Nombre del Museo | Institución | Administración | Región | Resolución de Incorporación | Fecha de Incorporación |
|---|---|---|---|---|---|
| Museo de Historia Natural Javier Prado de la Universidad Nacional Mayor de San Marcos | Universidad Nacional Mayor de San Marcos | Pública | Lima | Resolución Jefatural Nº 102 | 27/03/1989 |
| Museo "Maguiña Cueva" | - | Privada | Lima | Resolución Jefatural Nº 102 | 27/03/1989 |
| Museo Dinámico de Ciencia | Ministerio de Educación | Pública | Lima | Resolución Jefatural Nº 102 | 27/03/1989 |
| Museo Convento de San Francisco | Convento de San Francisco | Privada | Lima | Resolución Jefatural Nº 102 | 27/03/1989 |
| Museo de Arte y de Historia de la Universidad Nacional Mayor de San Marcos | Universidad Nacional Mayor de San Marcos | Pública | Lima | Resolución Jefatural Nº 102 | 27/03/1989 |
| Museo de Ciencia y Tecnología José Castro Mendívil del ITINTEC | - | Pública | Lima | Resolución Jefatural Nº 102 | 27/03/1989 |
| Museo Municipal del Teatro | Municipalidad Metropolitana de Lima | Pública | Lima | Resolución Jefatural Nº 102 | 27/03/1989 |
| Museo del Banco Central de Reserva del Perú | Banco Central de Reserva del Perú | Pública | Lima | Resolución Jefatural Nº 102 | 27/03/1989 |
| Museo Conmemorativo Inmigración Japonesa en el Perú | Asociación Peruano Japonesa | Privada | Lima | Resolución Jefatural Nº 102 | 27/03/1989 |
| Museo del Ejército "Real Felipe" | Ministerio de Defensa | Pública | Callao | Resolución Jefatural Nº 102 | 27/03/1989 |