| Nombre del Museo | Institución | Administración | Región | Resolución de Incorporación | Fecha de Incorporación |
|---|---|---|---|---|---|
| Museo Huauco | - | Privada | Cajamarca | Resolución Directoral Nº 1305/INC | 27/09/2005 |
| Museo "Complejo Histórico Benemérita Guardia Civil del Perú-ACENESPAR GC" | - | Privada | Lima | Resolución Directoral Nacional N° 276 /INC | 14/04/2004 |
| Museo Aeronáutico del Perú | Fuerza Aérea del Perú | Pública | Lima | RDN N° 593-INC | 06/08/2004 |
| Museo Afroperuano | Consejo Directivo del Museo | Privada | Lambayeque | Resolución Directoral Nacional N° 915 /INC | 23/09/2004 |
| Cementerio Museo Presbítero Matías Maestro | Sociedad de Beneficencia de Lima | Pública | Lima | Resolución Directoral Nacional N° 593/INC | 12/08/2003 |
| Museo del Colegio Militar "Elías Aguirre" | Colegio Militar Elías Aguirre | Pública | Lambayeque | Resolución Directoral Nacional N° 745 /INC | 22/10/2003 |
| Museo Leymebamba | Privada | Amazonas | Resolución Directoral Nacional Nº 080- INC | 05/02/2002 | |
| Museo de Sitio de Ancón "Alejando Miró Quesada Garland" | Patronato del Museo de Sitio de Ancón | Privada | Lima | Resolución Directoral Nacional N° 081 /INC | 05/02/2002 |
| Sala Postal y Filatélica de Tacna | Serpost | Pública | Tacna | Resolución Directoral Nacional N° 812 /INC | 03/09/2002 |
| Museo Municipal de Asia "Huaca Malena" | Municipalidad Distrital de Asia | Pública | Lima | Resolución Directoral Nacional N° 1022 /INC | 29/10/2002 |