| Nombre del Museo | Institución | Administración | Región | Resolución de Incorporación | Fecha de Incorporación |
|---|---|---|---|---|---|
| Museo Arqueológico Josefina Ramos de Cox | Instituto Riva Agüero-Pontificia Universidad Católica del Perú | Privada | Lima | Resolución Jefatural Nº 102 | 27/03/1989 |
| Museo Criminalística (PIP) | Policía Nacional del Perú | Pública | Lima | Resolución Jefatural Nº 102 | 27/03/1989 |
| Museo Postal y Filatélico del Perú | Ministerio de Cultura | Pública | Lima | Resolución Jefatural Nº 102 | 27/03/1989 |
| Museo Naval “Capitán de Navío Julio Elías Murguía” | Marina de Guerra del Perú | Pública | Callao | Resolución Jefatural Nº 102 | 27/03/1989 |
| Museo de Arte Popular del Instituto Riva Agüero de la Pontifica Universidad Católica del Perú | Instituto Riva Agüero-Pontificia Universidad Católica del Perú | Privada | Lima | Resolución Jefatural Nº 102 | 27/03/1989 |
| Museo de Historia Natural Javier Prado de la Universidad Nacional Mayor de San Marcos | Universidad Nacional Mayor de San Marcos | Pública | Lima | Resolución Jefatural Nº 102 | 27/03/1989 |
| Museo "Maguiña Cueva" | - | Privada | Lima | Resolución Jefatural Nº 102 | 27/03/1989 |
| Museo Dinámico de Ciencia | Ministerio de Educación | Pública | Lima | Resolución Jefatural Nº 102 | 27/03/1989 |
| Museo Convento de San Francisco | Convento de San Francisco | Privada | Lima | Resolución Jefatural Nº 102 | 27/03/1989 |
| Museo de Arte y de Historia de la Universidad Nacional Mayor de San Marcos | Universidad Nacional Mayor de San Marcos | Pública | Lima | Resolución Jefatural Nº 102 | 27/03/1989 |